考评体系的不完善，导致高校教师为了完成科研考核指标而急功近利，影响高校科研工作的良性发展，使得有些学科被扼制在不合理的规定中，举步维艰，影响高校学科的协调发展。特别在当代的科学研究工作中，跨学科、跨单位的大型综合性项目越来越多，对建立科学合理的科研评价体系更显重要。

　　(5)管理体制、机构不合理

　　受传统计划经济体制的影响以及国内高校体制改革进程的缓慢，使得多数高校的科研依然沿用自上而下的行政化管理体制，这种管理体制使得只有科研管理部门有更多的机会与省市或国家的相关科研需求部门有更多的联系，但割裂了科研一线工作队伍与科研需求单位之间的直接联系，这使得科研需求与科研能力队伍之间出现了信息不对称。另外，部分高校科研管理单位缺乏为学校、为科研队伍服务的宗旨，使得外部科研的真正需求传达到一线科研人员，进而一线科研队伍的能力很难被外部需求单位所认可。

　　(6)激励不清，制度不完善

　　为了鼓励科研人员多出成果、出大成果，各个高校都在不同程度地加大了对科研人员奖励的力度。多数高校为调动科教人员的科技创新积极性，对凡拥有过重大项目、科技成果、品种、专利、论文、著作等都给予奖励，且主要是以量化的物质奖励为主，但对于对学校科学研究做出重大贡献，但很难以量化的科技成果衡量的却不予以奖励。这种缺乏个性化的奖励制度固然吸引了一大批优秀人才从事科研工作，也相继出了一批有影响的科技成果。但同时也带来了一定的不利因素。如片面追求学校的奖励对象，对真正可促进学校基础科研能力提升的基础工作重视程度不够，同时也打击了许多潜心研究人员的积极性，也使得学校的“科研泡沫”越来越严重。

　　(7)队伍不稳定，管理水平参差不齐

　　高校科研管理工作是一项非常复杂的系统，是一个业务性非常强的部门。所以就需要一支稳定、懂业务、会管理的高素质队伍。但是，许多高校科研管理队伍不稳定，经常随意频繁地更换科研管理人员。尤其是各学院科研秘书随意性更大，换人的频率更是尤为突出。造成了一种任何人都可以管科研的现状。加之领导对科研管理队伍的重视不够，对管理人员的使用上存在着“重使用、轻培养”的倾向，缺乏激励机制。导致管理队伍不稳定，管理人员积极性不高。

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