长非编码RNA(long non-coding RNAs)是一类长度大于200 nt的非编码RNA。已有研究表明,长非编码RNA具有重要的调控功能,在植物和动物的生物学过程中发挥重要作用。此外,lncRNA还与人类一些疾病的发生发展密切相关。因此,对lncRNA的注释、探索lncRNA的功能具有重要意义。近年来,一些研究集中于lncRNA功能的探索,但综合全面的lncRNA的注释仍需不断更新维护。
NONCODE数据库于2005年创建,受到Science专文推荐,由中国科学院计算技术研究所、生物物理研究所团队长期维护;2013年,受邀以专家数据库加入国际RNA联盟RNAcentral,数据库首次提出了非编码基因的分类体系,建立了多项非编码领域标准,推动了长非编码RNA的研究发展。
近期,中科院院士、生物物理所研究员陈润生课题组,生物物理所健康大数据研究中心研究员何顺民课题组和计算所研究员赵屹课题组合作,在Nucleic Acids Research上,在线发表题为NONCODEV6: an updated database dedicated to long non-coding RNA annotation in both animals and plants的研究论文(图1)。该工作NONCODEV6(
图1.NONCODEV6在线发表
图2.NONCODEV6数据库